Für digitale EOS-Kameras, deren Sensor kleiner ist als das Kleinbildformat, werden spezielle Objektive hergestellt, die diesem Umstand Rechnung tragen. Diese Objektive, die als EF-S-Objektive bezeichnet werden, können kompakter gebaut werden und ragen weiter in die Kamera hinein. Sie können an den EOS-Kameras 300D, 350D, 20D und 30D (Stand: Februar 2006) verwendet werden, nicht jedoch an den Modellen mit Vollformatsensor (1Ds, 5D) und nicht an Kameras, die zwar einen kleineren Sensor aufweisen, aber kein EF-S-Bajonett haben (D30, D60, 10D, 1D). An den Kameras mit EF-S-Bajonett können auch die herkömmlichen EF-Objektive verwendet werden, wobei sich die Brennweite der Objektive um den Faktor 1,6 verlängert (berechnet auf Kleinbildformat, siehe Formatfaktor) (bei der EOS 1D Mark II um den Faktor 1,3).